鲁东大学学报（自然科学版） Ｌｕｄｏｎｇ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｊｏｕｒｎａｌ（Ｎａｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｅｄｉｔｉｏｎ） Ｍａｆ家族基因的系统演化分析 于 洋，李红岩，张士璀 （中国海洋大学海洋生命学院，山东青岛２６６００３） 摘要：Ｍａｆ家族基因编码是一类含有碱性结构域和ｂ－Ｚｉｐ的转录因子，Ｍａｆ基因编码的蛋白在血细胞发生、胰 腺分化、眼睛晶状体发育等多个过程中起重要作用，但目前该基因家族的进化并不清楚．本文首先搜索了不 同基因组中的可能的Ｍａｆ家族基因，对其染色体定位、基因结构、编码蛋白的功能域等进行分析，并构建系统 进化树研究了该基因家族的进化． 关键词：Ｍａｆ；分类；演化 中图分类号：Ｑ３４９ 文献标志码：Ａ 文章编号：１６７３．８０２０（２０１４）０４ ０３３０．０６ Ｍａｆ基因家族属于转录因子，最早发现的该 家族基因是ｖ－ｍａｆ基因，它是在可引起鸟类肌腱 Ｍａｆ家族成员包括ｃ．Ｍａｆ，ＭａｆＢ／Ｋｒｅｉｓｌｅｒ，ＭａｆＡ和 ＮＲＬ ，鸡中发现有３个大Ｍａｆ家族基因，Ｌ— 膜纤维瘤病毒ＡＳ４２的基因组中发现的．目前，已 有多个Ｍａｆ家族基因在不同物种中均已被克隆， 包括人、小鼠、爪蛙、鸡以及斑马鱼等．Ｍａｆ家族基 因编码的蛋白质都有一个高度保守的ｂａｓｉｃ Ｍａｆ，ＭａｆＢ和ｃ－Ｍａｆ ｌｏｊ．在斑马鱼中也已鉴定到这 些大Ｍａｒ家族基因的同源基因，其中有两个是 ＭａｆＢ的同源基因，分别是Ｖａｌ和Ｋｒｍ１．果蝇和线 虫中均只找到一个大Ｍａｆ家族基因．在人、小鼠、 ｒｅｇｉｏｎ，一个位于羧基端的ｂＺＩＰ功能域，该功能域 可以使Ｍａｆ蛋白质和其靶ＤＮＡｓ结合，一般是通 过与Ｔ－ＭＡＲＥ或Ｃ—ＭＡＲＥ识别位点结合¨ ｊ． Ｍａｆ蛋白质的ｂＺＩＰ也可与其自身或其它含有 ｂＺＩＰ功能域的蛋白质形成二聚体 ． 鸡、爪蛙、斑马鱼中均找到３个小Ｍａｆ家族基因， 人、小鼠、鸡、爪蛙中为ＭａｆＦ、ＭａｆＫ，ＭａｆＧ，而在斑 马鱼中有ＭａｆＫ，两个ＭａｆＧ的同源基因，却没有 ＭａｆＦ，而有一个新成员ＭａｔＴ的存在… ．文昌鱼属 于头索动物，在进化上具有极其重要的地位，但该 物种中存在哪些Ｍａｒ家族成员尚不清楚． Ｃｏｏｌｅｎ等 系统地分析了不同物种的大Ｍａｆ 家族，研究了大Ｍａｆ家族的系统演化关系，并根据 系统进化树等信息确定了不同物种的各大Ｍａｆ基 因的确切名称，如根据系统进化树，爪蛙中过去认 为ＭａｆＡ的同源基因Ｌ．ＭａＬｆ其实是ＮＲＬ的同源基 因，鸡的Ｌ．Ｍａｆ是Ｍａｆ的同源基因． 基于此，本文将首先利用已测序的佛罗里达 Ｍａｆ家族蛋白根据其分子量大小可分为两大 类，大Ｍａｆ蛋白和小Ｍａｆ蛋白．大Ｍａｆ蛋白和小 Ｍａｆ蛋白的结构有差别，大Ｍａｆ家族基因编码的 蛋白质羧基端既有与ＤＮＡ结合的ｂＺＩＰ功能域， 在其氨基端也有富含脯氨酸、丝氨酸以及苏氨酸 的转录激活域 ｊ．而小Ｍａｆ家族基因编码的蛋白 质缺少转录激活区，作为伴侣蛋白起作用，如可能 通过与含有ｂＺＩＰ的ＣＮＣ形成异源二聚体从而起 到转录激活的作用 ． Ｍａｆ基因在各种脊椎动物模式动物中均已鉴 文昌鱼的基因组信息，确定文昌鱼中的Ｍａｆ家族 成员组成，同时结合已有报道，搜索其它不同进化 定，除线虫基因组中只找到一个Ｍａｆ基因外，大部 分无脊椎动物如海胆和果蝇等以及尾索动物海鞘 均有一个大Ｍａｆ基因和一个小Ｍａｆ基因．而大部 分脊椎动物如人、小鼠以及爪蛙中已鉴定的大 地位代表性生物中的Ｍａｆ基因，并系统分析这些 Ｍａｆ家族成员的特征，并结合系统演化分析确定 Ｍａｆ家族的进化． 收稿１３期：２０１４—０９一ｌ８；修回１３期：２０１４－１０－０９ 基金项目：山东省自然科学基金重点基金（ＺＲ２０１１ＣＺＯＯ４） 作者简介：于洋（１９８８一），女，山东烟台人。硕士研究生，研究方向为发育生物学。Ｅ—ｍａｉｌ：ｙｕｙａｎｇ３６４４＠ｇｍａｉｌ．ａｏｍ。 通讯作者：张士璀（１９５７一），男，江苏泗阳人。教授，博士研究生导师，博士，研究方向为发育、免疫与进化生物学。Ｅ—ｍａｉｌ：ｓｃｚｈａｎｇ ＠ＯｔｌＣ．ｅｄｕ．ｃｎｏ 第４期 于洋，等：Ｍａｆ家族基因的系统演化分析 ３３１ １ 方法 佛罗里达文昌鱼Ｍａｆ基因序列是从ＪＧＩ数据 库（ｈｔｔｐ：／／ｇｅｎｏｍｅ．ｊｇｉ—ｐｓｆ．ｏｒｇ／Ｂｒａｆｌｌ／Ｂｒａｌｆ１． ｈｏｍｅ．ｈｔｍ１）运用ＢＬＡＳＴｐ找出的同源基因序列， 蛋白序列是根据上述基因序列在ＤＮＡ Ｓｔａｒ软件 中翻译而来［１ ．这些基因及蛋白序列可用于后 续研究．其它物种中的序列均从ＮＣＢＩ中直接或 通过ＢＬＡＳＴｐ或ｔＢｌａｓｔｎ搜索得到，之后对基因序 列进行内含子一外显子分析，并对其编码的蛋白 进行特征分析．用ＳＭＡＲＴ软件对蛋白的功能域 进行预测． 系统进化树的构建：首先将不同物种的Ｍａｒ序 列用ＭＥＧＡ５．０软件中的Ｍｅｇａｌｉｇｎ进行序列比对， 之后利用Ｎｅｉｇｈｂｏｒ ｊｏｉｎｉｎｇ方法构建系统进化树，进 行１０００次自引导复制（ｂｏｏｔｓｔｒａｐ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ） １４］． ２ 结果 ２．１ 不同生物的Ｍａｆ基因家族及特征 不同代表性模式生物的Ｍａｆ家族成员及特征 见表１，我们所搜索的代表性模式生物的基因组 中均有Ｍａｒ基因的存在，这些基因在染色体上均 是散在分布的．脊椎动物中均有大Ｍａｕｆ和小Ｍａｆ 基因，爪蛙、小鼠、人的基因组中均有４个大Ｍａｒ－ ＭａｆＡ，ＭａｆＢ，ｃ．Ｍａｆ，Ｎｒｌ，３个小Ｍａｒ－ＭａｒＫ，ＭａｆＧ， ＭａｆＦ．鸡的基因组中没有找到Ｎｒｌ，只有另外三个 大Ｍａｆ．斑马鱼中的Ｍａｆ成员最多，有５个大Ｍａｆ 以及４个小Ｍａｆ基因的存在，这与硬骨鱼比脊椎 动物多的一次基因组复制有关．斑马鱼中存在两 个复制的ＭａｆＢ—ＭａｆＢａ和ＭａｆＢｂ以及两个复制的 ＭａｆＧ—ＭａｆＧａ和ＭａｆＧｂ．在头索动物文昌鱼和尾索 动物海鞘中，均找到两个Ｍａｆ，一个是大Ｍａｆ，一个 是小Ｍａｆ．在无脊椎动物中，海胆和果蝇中均找到 两个Ｍａｆ成员，一个是大Ｍａｆ，一个是小Ｍａｆ．而在 线虫中，只有一个小Ｍａｆ的存在． 不同物种中Ｍａｆ基因编码的蛋白大小有一定 的保守性，如大Ｍａｆ蛋白，其中的ＭａｆＡ，ＭａｆＢ和 ｃ—Ｍａｒ编码的蛋白要大一些，一般都在３００个氨基 酸以上，而Ｎｒｌ编码的蛋白则要小一些，一般在 ２３０个氨基酸左右，但也有一些例外，如鸡和爪蛙 的ＭａｆＡ蛋白质明显小于其他物种的ＭａｆＡ，斑马鱼 表１不同物种的Ｍａｒ基因及其特征 ３３２ 鲁东大学学报（自然科学版） 第３Ｏ卷 的Ｎｒｌ基因编码一个包含４１２个氨基酸的蛋白， 这明显大于其他物种的Ｎｄ．文昌鱼、海鞘以及其 它无脊椎动物的大Ｍａｆ的蛋白相差较大，文昌鱼、 海鞘、海胆、果蝇的大Ｍａｒ蛋白分别为２９１、４２９、 ３７０、５０９个氨基酸．不同物种的小Ｍａｆ蛋白的长 度相差不大，均小于２００个氨基酸，大部分都在 １５０～１７０个氨基酸之间．果蝇中的小Ｍａｆ蛋白最 小，只有１３７个氨基酸． 不同物种的Ｍａｆ蛋白的基因结构既有一定的 保守性，也有不同．大Ｍａｒ的基因结构并不相同． 如脊椎动物的ＭａｆＡ和ＭａｆＢ都由单个外显子组 成．而脊椎动物的ｃ．Ｍａｆ的基因结构却不保守， 人、小鼠、爪蛙的ｃ。Ｍａｆ都由单个外显子组成，大 鼠和鸡的ｃ．Ｍａｆ由４个外显子，３个内含子组成． 而斑马鱼的ｃ－Ｍａｆ由３个外显子，２个内含子组 成．头索动物文昌鱼的大Ｍａｒ基因由单外显子组 成，尾索动物海鞘由３个外显子和两个内含子组 成．海胆的则由单外显子组成．小ＭａＬｆ的基因结构 均由多个外显子组成．不同物种中的不同小Ｍａｆ 的基因结构没有保守性，从２个外显子到８个外 显子不等． ２．２不同生物Ｍａｆ家族基因的系统进化关系 对各种不同生物的Ｍａｆ家族成员构建进化 树，如图１所示：不同生物的大Ｍａｆ家族基因、小 Ｍａｒ家族基因各自聚为一大枝，而线虫的Ｍａｆ位 于进化树的基部．大Ｍａｆ家族中，脊椎动物的大 Ｍａｆ亲缘关系更近，聚为一大支，而其中ＭａｆＡ， ＭａｆＢ，ｃ—Ｍａｆ，Ｎｒｌ各自聚为一支。而头索动物文昌 鱼、尾索动物海鞘、无脊椎动物海胆和果蝇的大 Ｍａｆ位于脊椎动物大Ｍａｆ家族基因的基部．小Ｍａｆ 家族中，脊椎动物的小Ｍａｆ家族成员聚为一大支， 而其中除了爪蛙的ＭａｆＦ外，脊椎动物的ＭａｆＦ， ＭａｆＧ，ＭａｆＫ各自聚为一支，Ｔａｋａｇｉ等 鉴定的斑 马鱼中的新的小Ｍａｆ基因ＭａｔＴ实际上就是Ｍａｔｔ 的同源基因．而头索动物文昌鱼、尾索动物海鞘、 无脊椎动物海胆和果蝇的小Ｍａｆ位于脊椎动物小 Ｍａｆ家族基因的基部．由此，可以推断，后生生物 中，最初只有一个Ｍａｆ成员，之后在无脊椎动物及 头索动物、尾索动物中则进化出大Ｍａｆ和小Ｍａｆ 各一个成员，在脊椎动物中，小Ｍａｒ进化出了三个 成员Ｍａｔｔ，ＭａｆＧ和ＭａｆＫ，而大Ｍａｆ则进化出了 四个成员ＭａｆＡ，ＭａｆＢ，ｃ—Ｍａｆ以及Ｎｒ１．由于硬骨鱼 中多出一次基因组复制，部分基因出现了复制． ３ 讨论 Ｍａｒ基因家族属于比较保守的基因家族，在 后生生物中均存在．但不同进化地位生物中的 Ｍａｆ基因家族也各有其特征，如不同进化地位生 物中的Ｍａｆ基因家族的成员各不相同．如已知脊 椎动物一般均包括４个大Ｍａｒ基因，３个小Ｍａｆ 基因．鸡中只有３个大Ｍａｆ基因，可能是进化过程 中Ｎｒｌ发生丢失 ．而斑马鱼中则有５个大Ｍａｒ 基因，４个小Ｍａｒ基因．是因为硬骨鱼多出的一个 基因组复制，Ｍａｒｌ３和ＭａｆＧ均发生了基因复 制 ．我们发现文昌鱼和尾索动物海鞘一样，只 有一个大Ｍａｆ基因，一个小Ｍａｆ基因．无脊椎动物 果蝇、海胆等也各有一个大Ｍａｆ基因和一个小 Ｍａｆ基因．而线虫中则只找到一个Ｍａｆ基因．系统 进化分析显示该Ｍａｆ位于整个进化树的基部．认 为首先是一个Ｍａｆ基因进化出一个大Ｍａｆ基因， 一个小Ｍａｆ基因．之后在大部分脊椎动物中复制 出４个大Ｍａｆ基因，４个小Ｍａｆ基因．而在其中一 些脊椎动物如鸡和斑马鱼中，有的基因丢失，有的 基因发生复制，出现不同数目的大Ｍａｆ和小Ｍａｆ 基因． 从基因结构来看，有的Ｍａｆ基因如大Ｍａｒ基 因ＭａｆＡ和ＭａｆＢ，有较为保守的内含子一外显子 结构，而大部分Ｍａｆ基因则有不保守的内含子一 外显子结构．对不同物种Ｍａｆ基因编码蛋白的大 小以及功能域分析表明，从无脊椎动物到脊椎动 物，Ｍａｆ基因编码的蛋白大小不同，均可分为大 Ｍａｆ和小Ｍａｆ，大小Ｍａｆ均含有ｂＺＩＰ，可以和ＤＮＡ 结合，而小Ｍａｆ没有转录激活区，而一般作为伴侣 蛋白是和其他含有ｂＺＩＰ的转录因子结合，共同起 转录激活的作用．序列比对结果表明，Ｍａｆ家族成 员的ｂＺＩＰ功能域的同源性较高，ｂＺＩＰ之外的其 他序列的同源性较低． Ｍａｆ家族基因不同成员的表达部位多样，也 执行多样化的功能．其中脊椎动物的Ｍａｆ基因的 研究最多．小鼠、斑马鱼、鸡等脊椎动物的大Ｍａｆ 基因均已有系统研究＿９， 脊椎动物的同源Ｍａｆ 的表达及功能有保守性，但也有物种特异性． 第４期 于洋，等：Ｍａｒ家族基因的系统演化分析 ＭａｆＦ ＭａｆＫ ＭａｆＧ Ｎｒｌ ｃ．Ｍａｆ ＭａｆＢ ＭａｆＡ 图１不同物种的Ｍａｒ系统进化树 ３３３ ∽ 鲁 巴 一 黑 ∞ ３３４ 鲁东大学学报（自然科学版） 第３０卷 如很多大Ｍａｆ家族成员都表达在眼睛的晶状体细 胞上，如鸡的Ｌ—Ｍａｆ，即人和小鼠ＭａｆＡ的同源基 因 １８］，在发育中的晶状体细胞上有表达，而且Ｌ— Ｍａｆ的表达能够提示晶状体的分化．ＲＴ—ＰＣＲ的结 果显示小鼠的ＭａｆＡ在眼睛中也有表达．爪蛙的 ＭａｆＡ在晶状体纤维细胞中也有表达¨ ．鸡、小 鼠、大鼠等的ｃ Ｍａｆ均在晶状体上有较强的表达， 但表达有差异，如小鼠ｃ－Ｍａｆ的表达首先在预定 的晶状体外胚层，之后在发育的晶状体上表达，而 且其主要表达在纤维细胞，在上皮细胞中表达较 弱，而大鼠的ｃ．Ｍａｆ则完全表达在晶状体纤维细 胞中［２０－２１ Ｊ．小鼠的Ｎｒｌ不在发育的晶状体表达， 而在神经系统表达 ．人的Ｎｒｌ则主要表达在视 网膜、晶状体和脑中．Ｍａｆ家族基因的不同表达模 式提示它们在晶状体形成、神经系统等过程中起 不同的重要作用，除此，Ｍａｆ家族基因在肿瘤发 生、免疫系统、胰岛素产生、细胞分化以及细胞凋 亡中也起很重要的作用，而且不同的大Ｍａｆ的功 能既有一定的重复，也有各自的特异性Ｈ 一 ． 不同小Ｍａｆ家族成员的表达有一定的重叠，但也 有一定的特异性 ．ＭａｆＫ，ＭａｆＦ单独基因敲除 的小鼠都没有出现明显的表型 卜 ，而ＭａｆＧ 敲除的小鼠则出现了神经系统和血管系统的缺 陷＿２ ．而ＭａｆＧ和ＭａｆＫ基因共敲除的小鼠则表 型要严重得多．这说明ＭａｆＧ和ＭａｆＫ执行的功能 是类似的 ． 如上所述，目前脊椎动物中Ｍａｆ的表达功能 相对较多，而脊索动物以及无脊椎动物中Ｍａｆ基 因的表达及功能研究很少，大、小Ｍａｆ是否能够执 行脊椎动物多个成员的多样化功能均不清楚，有 待于进一步研究．而Ｍａｆ家族基因的系统分析将 为进一步的研究打下很好的基础． 参考文献： ［１］ Ｋａｔａｏｋａ Ｋ，Ｆｕｊｉｗａｒａ Ｋ Ｔ，Ｎｏｄａ Ｍ，ｅｔ ａ１．ＭａｆＢ，ａ ｎｅｗ Ｍａｆ ｆａｍｉｌｙ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ａｃｔｉｖａｔｏｒ ｔｈａｔ ｃａｎ ａｓｓｏｃｉａｔｅ ｗｉｔｈ Ｍａｆ ａｎｄ Ｆｏｓ ｂｕｔ ｎｏｔ ｗｉｔｈ Ｊｕｎ『Ｊ］．Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ， １９９４，１４（１１）：７５８１—７５９１ ［２］ Ｋａｔａｏｋａ Ｋ，Ｎｏｄａ Ｍ，Ｎｉｓｈｉｚａｗａ Ｍ．Ｍａｆ ｎｕｃｌｅａｒ ｏｎｃｏｐ－ ｒｏｔｅｉｎ ｒｅｃｏｇｎｉｚｅｓ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｒｅｌａｔｅｄ ｔｏ ａｎ ＡＰ一１ ｓｉｔｅ ａｎｄ ｆｏｒｍｓ ｈｅｔｅｒｏｄｉｍｅｒｓ ｗｉｔｈ ｂｏｔｈ Ｆｏｓ ａｎｄ Ｊｕｎ ｌ Ｊ Ｉ． Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ，１９９４，１４（１）：７００—７１２． ［３］ Ｂｌａｎｋ Ｖ．Ａｎｄｒｅｗｓ Ｎ Ｃ．Ｔｈｅ Ｍａｆ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒｓ： ｒｅｇｕｌａｔｏｒｓ ｏｆ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ［Ｊ］．Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｓｃｉ， １９９７，２２（１１）：４３７—４４１ ［４］Ｍｏｔｏｈａｓｈｉ Ｈ，Ｓｈａｖｉｔ Ｊ Ａ，Ｉｇａｒａｓｈｉ Ｋ，ｅｔ １ａ．Ｔｈｅ ｗｏｒｌｄ ａｃｃｏｒｄｉｎｇ ｔｏ Ｍａｒ［Ｊ］．Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ，１９９７，２５ （１５）：２９５３—２９５９． ［５］ Ｓｗａｒｏｏｐ Ａ，Ｘｕ Ｊ Ｚ，Ｐａｗａｒ Ｈ，ｅｔ ａ１．Ａ ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ ｒｅｔｉｎａ・－ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｇｅｎｅ ｅｎｃｏｄｅｓ ａ ｂａｓｉｃ ｍｏｔｉｆ／ｌｅｕｃｉｎｅ ｚｉｐ・－ ｐｅｒ ｄｏｍａｉｎ［Ｊ］．Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ，１９９２，８９ （１）：２６６—２７０． ［６］ Ｃｏｒｄｅｓ Ｓ Ｐ，Ｂａｒｓｈ Ｇ Ｓ．Ｔｈｅ ｍｏｕｓｅ ｓｅｇｍｅｎｔａｔｉｏｎ ｇｅｎｅ Ｋｒ ｅｎｃｏｄｅｓ ａ ｎｏｖｅｌ ｂａｓｉｃ ｄｏｍａｉｎ—ｌｅｕｃｉｎｅ ｚｉｐｐｅｒ ｔｒａｎ－－ ｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ［Ｊ］．Ｃｅｌｌ，１９９４，７９（６）：１０２５—１０３４． ［７］ Ｋｕｒｓｃｈｎｅｒ Ｃ，Ｍｏｒｇａｎ Ｊ Ｉ．Ｔｈｅ ｍａｆ ｐｒｏｔｏ—ｏｎｃｏｇｅｎｅ ｓｔｉｍｕｌａｔｅｓ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆｒｏｍ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｓｉｔｅｓ ｉｎ ａ ｐｒｏｍｏｔｅｒ ｔｈａｔ ｄｉｒｅｃｔｓ Ｐｕｒｋｉｎｊｅ ｎｅｕｒｏｎ—ｓｐｅｃｉｉｆｃ ｇｅｎｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ［Ｊ］．Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ，１９９５，１５（１）：２４６ －２５４． ［８］ Ｏｌｂｒｏｔ Ｍ，Ｒｕｄ Ｊ，Ｍｏｓｓ Ｌ Ｇ，ｅｔ ａ１．Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｂｅｔａ・・ｃｅｌｌ・・ｓｐｅｃｉｉｆｃ ｉｎｓｕｌｉｎ ｇｅｎｅ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ ＲＩＰＥ３ｂｌ ａｓ ｍａｌｎｍａｌｉａｎ ＭａｆＡ［Ｊ］．Ｐｒｏｃ Ｎａｔ１ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ，２００２，９９（１０）：６７３７—６７４２． ［９］ Ｃｏｏｌｅｎ Ｍ，Ｓｉｉ—Ｆｅｌｉｃｅ Ｋ，Ｂｒｏｎｃｈａｉｎ Ｏ，ｅｔ ａ１．Ｐｈｙｌｏｇ— ｅｎｏｍｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｐａｔｔｅｒｎｓ ｏｆ ｌａｒｇｅ Ｍａｒ ｇｅｎｅｓ ｉｎ Ｘｅｎｏｐｕｓ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ ｐｒｏｖｉｄｅ ｎｅｗ ｉｎｓｉｇｈｔｓ ｉｎｔｏ ｔｈｅ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｙ ｉｎ ｏｓｔｅｉｃｈ— ｔｈｙａｎｓ［Ｊ］．Ｄｅｖ Ｇｅｎｅｓ Ｅｖｏｌ，２００５，２１５（７）：３２７—３３９． ［１０］ Ｂｅｎｋｈｅｌｉｆａ Ｓ，Ｐｒｏｖｏｔ Ｓ，Ｎａｂａｉｓ Ｅ，ｅｔ ａ１．Ｐｈｏｓｐｈｏｒｙｌａｔｉｏｎ ｏｆ ＭａｆＡ ｉａ ｅｓｓｅｎｔｉａｌ ｆｏｒ ｉｔｓ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ ａｎｄ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ［Ｊ］．Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ，２００１，２１（１４）： ４４４１—４４５２． ［１１］Ｔａｋａｇｉ Ｙ，Ｋｏｂａｙａｓｈｉ Ｍ，Ｌｉ Ｌ，ｅｔ ａ１．ＭａｔＴ，ａ ｎｅｗ ｍｅｍ・ ｂｅｔ ｏｆ ｔｈｅ ｓｍａｌｌ Ｍａｆ ｐｒｏｔｅｉｎ ｆａｍｉｌｙ ｉｎ ｚｅｂｒａｆｉｓｈ［Ｊ］． Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｂｉｏｐｈｙｓ Ｒｅｓ Ｃｏｍｍｕｎ，２００４，３２０（１）：６２ —６９． ［１２］Ｐｕｔｎａｍ Ｎ Ｈ，Ｂｕｔｔｓ Ｔ，Ｆｅｒｒｉｅｒ Ｄ Ｅ，ｅｔ ａ１．Ｔｈｅ ａｍｐｈｉｏｘｕｓ ｇｅｎｏｍｅ ａｎｄ ｔｈｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｃｈｏｒｄａｔｅ ｋａｒｙｏｔｙｐｅ［Ｊ］．Ｎａｔｕｒｅ，２００８，４５３（７１９８）：１０６４—１０７１． ［１３］ Ｂｕｒｌａｎｄ Ｔ Ｇ．ＤＮＡＳＴＡＲ’ｓ Ｌａｓｅｒｇｅｎｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎａｌ— ｙｓｉｓ ｓｏｆｔｗａｒｅ［Ｊ］．Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ，２０００，１３２：７１ —９１． ［１４］Ｔａｍｕｒａ Ｋ，Ｐｅｔｅｒｓｏｎ Ｄ，Ｐｅｔｅｒｓｏｎ Ｎ，ｅｔ ａ１．ＭＥＧＡ５： ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｇｅｎｅｔｉｃｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｕｓｉｎｇ ｍａｘｉｍｕｍ ｌｉｋｅｌｉｈｏｏｄ，ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｄｉｓｔａｎｃｅ，ａｎｄ ｍａｘｉ— ｍｕｍ ｐａｒｓｉｍｏｎｙ ｍｅｔｈｏｄｓ［Ｊ］．Ｍｏｌ Ｂｉｏｌ Ｅｖｏｌ，２０１１，２８ （１０）：２７３１－２７３９． ［１５］ Ｋａｊｉｈａｒａ Ｍ，Ｋａｗａｕｃｈｉ Ｓ，Ｋｏｂａｙａｓｈｉ Ｍ，ｅｔ ａ１．Ｉｓｏｌａｔｉｏｎ， ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ，ａｎｄ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｚｅｂｒａｆｉｓｈ ｌａｒｇｅ Ｍａｆｓ［Ｊ］．Ｊ Ｂｉｏｃｈｅｍ Ｔｏｋｙｏ，２００１，１２９（１）：１３９—１４６． ［１６］ＹｏｓｈｉｄａＫ，Ｉｍａｋｉ Ｊ，ＫａｙａｍａＹ，ｅｔ ａ１．Ｄｉｆｅｒｅｎｔｉｌａ ｅｘｐｒｅｓ－ ｓｉｏｎ ｏｆ ｍａｒ——１ ａｎｄ ｍａｔ＂—。２ ｇｅｎｅｓ ｉｎ ｔｈｅ ｄｅｖｅｌｏｐｉｎｇ ｒａｔ 第４期 于洋，等：Ｍａｆ家族基因的系统演化分析 ３３５ ｌｅｎｓ［Ｊ］．Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ，１９９７，３８（１２）：２６７９ —ａｎｄ ｈｕｍａｎ［Ｊ］．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ，２００６，６６（２）：８１２—８１９． ［２５］Ｓｈａｖｉｔ Ｊ Ａ，Ｍｏｔｏｈａｓｈｉ Ｈ，Ｏｎｏｄｅｒａ Ｋ．ｅｔ ａ１．Ｉｍｐａｉｒｅｄ ｍｅｇａｋａｒｙｏｐｏｉｅｓｉｓ ａｎｄ ｂｅｈａｖｉｏｒａｌ ｄｅｆｅｃｔｓ ｉｎ ｍａｆＧ—ｎｕｌｌ ２６Ｂ３． 『１７］ Ｙｏｓｈｉｄａ Ｔ，Ｙａｓｕｄａ Ｋ．Ｃｈａｒｃｔａｅｒｉｚａｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｃｈｉｃｋｅｎ Ｌ－ Ｍａｆ．ＭａｆＢ ａｎｄ ｃ－Ｍａｒ ｉｎ ｃｒｙｓｔａｌｌｉｎｅ ｇｅｎｅ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ａｎｄ ｍｕｔａｔ ｍｉｃｅ［Ｊ］．Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ，１９９８，１２（１４）：２１６４ －ｌｅｎｓ ｄｉｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ［Ｊ］．Ｇｅｎｅｓ ｃｅｌｌｓ，２Ｏ０２，７（７）：６９３ —２１７４． ７０６． ［２６］ Ｏｎｅｄｅｒａ Ｋ，Ｓｈａｖｉｔ Ｊ Ａ，Ｍｏｔｏｈａｓｈｉ Ｈ，ｅｔ ａ１．Ｃｈａｒａｃｔｅｒ－ ｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｍｕｒｉｎｅ ｍａｆＧ ｇｅｎｅ［Ｊ］．Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ， １９９９，２７４（３０）：２１１６２—２１１６９ ［１８］Ｋａｔａｏｋａ Ｋ，Ｈａｎ Ｓ １，Ｓｈｉｏｄａ Ｓ，ｅｔ ａ１．ＭａｆＡ ｉｓ ａ ｕｃｏｓｅ－ ｒｅｇｕｌａｔｅｄ ａｎｄ ｐａｎｃｒｅａｔｉｃ ｂｅｔａ ｃｅｌｌ－ｓｐｅｃｉｉｆｃ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ ａｃｔｉｖａｔｏｒ ｆｏｒ ｈｅｔ ｉｎｓｕｌｉｎｅ ｇｅｎｅ［Ｊ］．Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ，２Ｏ０２，２７７ （５１）：４９９０３—４９９１０ ［２７］ Ｆｕｊｉｗａｒａ Ｋ Ｔ，Ｈａｔｏａｋａ Ｋ，Ｉｔｃｈ Ｋ，ｅｔ ａ１．Ｔｗｏ ｎｅｗ ｍｅｍｂｅｒｓ ｏｆ ｔｈｅ ｍａｆ ｏｎｃｏｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｙ，ｍａｆＫ ａｎｄ ｍａｗ， ｅｎｃｏｄｅ ｎｕｃｌｅａｒ ｂ－Ｚｉｐ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｌａｃｋｉｎｇ ｐｕｔａｔｉｖｅ ｔｒａｎｓ－ ［１９］ Ｉｓｈｉｂａｓｈｉ Ｓ，Ｙａｓｕｄａ Ｋ．Ｄｉｓｔｉｎｃｔ ｒｏｌｅｓ ｏｆ ｍａｒ ｇｅｎｅｓ ｄｕｒｉｎｇ ｘｅｎｏｐｕｓ ｌｅｎｓ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ［Ｊ］．Ｍｅｃｈ Ｄｅｖ， ２００１，１０１（１／２）：１５５—１６６． ａｃｔｉｖａｔｏｒ ｄｏｍａｉｎ［Ｊ］．Ｏｎｃｏｇｅｎｅ，１９９３，８（９）：２３７１ －２３８０． ［２０］Ｋａｗａｕｃｈｉ Ｓ，Ｔａｋａｈａｓｈｉ Ｓ，Ｎａｋａｊｉｍａ Ｏ，ｅｔ ａ１．Ｒｅｇｕｌａｉｔｏｎ ｏｆ ｌｅｎｓ ｆｉｅｒｂ ｃｅｌｌ ｄｉｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ ｂｙ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ ｃ— ［２８］ Ｋｏｔｋｏｗ Ｋ Ｊ，Ｏｒｋｉｎ Ｓ Ｈ．Ｃｏｍｐｌｅｘｉｔｙ ｏｆ ｔｈｅ ｅｒｙｔｈｒｏｉｄ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ ＮＦ—Ｅ２ ａｓ ｒｅｖｅａｌｅｄ ｂｙ ｇｅｎｅ Ｍａｆ［Ｊ］．Ｊ Ｂｉｏｌ Ｃｈｅｍ，１９９９，２７４（２７）：１９２５４—１９２６０． ［２１］ Ｓａｋａｉ Ｍ，Ｉｍａｋｉ Ｊ，Ｙｏｓｈｉｄａ Ｋ．ｅｔ ａ１．Ｒａｔ ｍａｆ ｒｅｌａｔｅｄ ｇｅｎｅｓ：ｓｐｅｃｉｆｃ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｉｎ ｃｈｏｎｄｒｏｃｙｔｅｓ ｌｅｎｓ ａｎｄ ｓｐｉ－ ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ｏｆ ｔｈｅ ｍｏｕｓｅ ｐｌ ８ ＮＦ—Ｅ２ ｌｏｃｕｓ［Ｊ］．Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ，１９９６，９３（８）：３５１４—３５１８． ［２９］ Ｏｎｏｄｅｒａ Ｋ，Ｓｈａｖｉｔ Ｊ Ａ，Ｍｏｔｏｈａｓｈｉ Ｈ，ｅｔ ａ１．Ｅｎｇｅｌ， Ｐｅｒｉｎａｔａｌ ｓｙｎｔｈｅｔｉｃ ｌｅｔｈａｌｉｔｙ ａｎｄ ｈｅｍａｔｏｐｏｉｅｔｉｃ ｄｅｆｅｃｔｓ ｎａｌ ｃｏｒｄ［Ｊ］．Ｏｎｃｏｇｅｎｅ，１９９７，１４（６）：７４５—７５０． ［２２］ “ｕ Ｑ，ｊｉ ｘ，Ｂｒｅｉｔｍａｎ Ｍ Ｌ，ｅｔ ａ１．，Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｂＺＩＰ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ ｇｅｎｅ Ｎｒｌ ｉｎ ｔｈｅ ｄｅｖｅｌｏｐｉｎｇ ｉｎ ｃｏｍｐｏｕｎｄ ｍａｆＧ：ｍａｆＫ ｍｕｔａｎｔ ｍｉｃｅ［Ｊ］．ＥＭＢＯ Ｊ， ２０００，１９（６）：１３３５—１３４５． ｎｅｒｖｏｕｓ ｓｙｓｔｅｍ［Ｊ］．Ｏｎｃｏｇｅｎｅ，１９９６，１２（１）：２０７ －［３０］ Ｋａｔｓｕｏｋａ Ｆ，Ｍｏｔｏｈａｓｈｉ Ｈ，Ｔａｍａｇａｗａ Ｙ，ｅｔ ａ１．Ｓｍａｌｌ Ｍａｆ ｃｏｍｐｏｕｎｄ ｍｕｔａｎｔｓ ｄｉｓｐｌａｙ ｃｅｎｔｒａｌ ｎｅｒｖｏｕｓ ｓｙｓｔｅｍ ｎｅｕｒｏｎａｌ ｄｅｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ，ａｂｅｒｒａｎｔ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ，ａｎｄ Ｂａｃｈ ｐｒｏｔｅｉｎ ｍｉｓｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ ｃｏｉｎｃｉｄｅｎｔ ｗｉｔｈ ２１１． ［２３］ Ｋｕｅｈｌｗ Ｍ，Ｂｅｒｇｓａｇｅｌ Ｐ１．Ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｍｙｅｌｏｍａ ｅｖｏｌｖｉｎｇ ｇｅｎｅｔｉｃ ｅｖｅｎｔｓ ａｎｄ ｈｏｓｔ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ［Ｊ］．Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｃａｎｃｅｒ，２００２，２（３）：１７５—１８７． ｍｙｏｃｌｏｎｕｓ ａｎｄ ａｂｎｏｒｍａｌ ｓｔａｒｔｌｅ ｒｅｓｐｏｎｓｅ［Ｊ］．Ｍｏｌ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌ，２００３，２３（４）：１１６３—１１７４． ［２４］Ｍｏｒｉｔｏ Ｎ，Ｙｏｈ Ｋ，Ｆｕｊｉｏｋａ Ｙ，ｅｔ ａ１．Ｏｖｅｒｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｏｆ ｃ—Ｍａｆ ｃｏｎｔｉｂｕｔｅｓ ｔｒｏ Ｔ—ｃｅｌｌ ｌｙｍｐｈｏｍａ ｉｎ ｂｏｔｈ ｍｉｃｅ Ｐｈｙｌ０ｇｅｎｅｔｉｃａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ Ｍａｆ Ｇｅｎｅ Ｆａｍｉｌｙ ＹＵ Ｙａｎｇ，ＬＩ Ｈｏｎｇ—ｙａｎ，ＺＨＡＮＧ Ｓｈｉ－ｃｕｉ （Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｍａｒｉｎｅ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｏｃｅａｎ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｃｈｉｎａ，Ｑｉｎｇｄａｏ ２６６００３，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｍａｆ ｆａｍｉｌｙ ｐｒｏｔｅｉｎｓ ａｒｅ ａ ｌａｒｇｅ ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ ｆａｃｔｏｒｓ ｗｈｉｃｈ ｉｎｃｌｕｄｅ ａ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ ｂａｓｉｃ ｒｅｇｉｏｎ ａｎｄ ａ ｌｅｕｃｉｎｅ ｚｉｐｐｅｒ（ｂ－Ｚｉｐ）ｍｏｔｉｆ．Ｔｈｅｙ ｐｌａｙ ｋｅｙ ｒｏｌｅｓ ｉｎ ｔｈｅ ｈｅｍａｃｙｔｏｐｏｉｅｓｉｓ，ｐａｎｃｒｅａｔｉｃ ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ，ａｎｄ ｔｈｅ ｌｅｎｓ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ ｅｙｅｓ．Ｈｏｗｅｖｅｒ，ｔｈｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎａｒｙ ｐｒｏｃｅｓｓ ｏｆ Ｍａｆ ｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｙ ｉｓ ｕｎ— ｋｎｏｗｎ．Ｉｎ ｔｈｉｓ ｓｔｕｄｙ，ｇｅｎｏｍｅ—ｗｉｄｅ ｓｕｒｖｅｙ ｏｆ Ｍａｆ ｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｙ ｗａｓ ｐｅｒｆｏｒｍｅｄ，ａｎｄ ｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅ ｌｏｃａｔｉｏｎ，ｇｅｎｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ，ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ ｍｏｔｉｆｓ ｏｆ Ｍａｆｓ ｗｅｒｅ ａｎａｌｙｚｅｄ．Ｔｏ ｅｘｐｌｏｒｅ ｔｈｅ ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ Ｍａｆ ｇｅｎｅ ｆａｍｉｌｙ ｗｉｔｈ ｔｈｅ ｓｔｒｕｃｔｉｏｎ ｏｆ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅ． Ｋｅｙ ｗｏｒｄｓ：Ｍａｆ；ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ；ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ （责任编辑 李维卫）
