法律分析：工程施工过程中破坏了耕地的，由施工单位承担赔偿责任。施工单位在施工过程中，非法破坏了耕地的，造成耕无法再进行农业生产的，由施工单位承担赔偿责任，造成实际损失的，按实际损失赔偿，并且要将耕地恢复到破坏前的状态，赔偿的方式包括赔偿造成的实际损失和恢复耕地原状等。
法律依据：《中华人民共和国土地管理法》 第三十条 国家保护耕地，严格控制耕地转为非耕地。国家实行占用耕地补偿制度。非农业建设经批准占用耕地的，按照“占多少，垦多少”的原则，由占用耕地的单位负责开垦与所占用耕地的数量和质量相当的耕地；没有条件开垦或者开垦的耕地不符合要求的，应当按照省、自治区、直辖市的规定缴纳耕地开垦费，专款用于开垦新的耕地。省、自治区、直辖市应当制定开垦耕地计划，监督占用耕地的单位按照计划开垦耕地或者按照计划组织开垦耕地，并进行验收。
