货物在运输过程中毁损如何认定责任主体视具体情况而定。
如果出卖人按照约定将标的物运送至买受人指定地点并交付给承运人后，标的物毁损、灭失的风险由买受人承担，货物在运输过程中毁损责任主体就是买受人。
【法律依据】
《中华人民共和国民法典》第八百三十二条，承运人对运输过程中货物的毁损、灭失承担赔偿责任。但是，承运人证明货物的毁损、灭失是因不可抗力、货物本身的自然性质或者合理损耗以及托运人、收货人的过错造成的，不承担赔偿责任。
《中华人民共和国民法典》第八百三十四条，两个以上承运人以同一运输方式联运的，与托运人订立合同的承运人应当对全程运输承担责任;损失发生在某一运输区段的，与托运人订立合同的承运人和该区段的承运人承担连带责任。
