两者主观故意的内容不同。贪污罪的主观故意是非法占有公共财物，不准备归还;而挪用罪的主观故意是暂时占有并使用，打算以后予以归还。行为人主观上是否具有非法占有的故意和目的是这两个罪名最重要的区别。而根据相关司法解释，“不归还”既包括主观上不想还，也包括客观上无力退还。如果行为人挪用以后由于客观原因缺乏偿还能力，无法归还亦被认定为非法占有公共财物，不准备归还，以贪污罪论处；两者的行为方式不同。贪污罪在客观上表现为使用侵吞、盗窃、骗取等方法将公共财物占为己有，由于行为人往往采取销毁、涂改、伪造单据、账目等手段，故在现实生活中难以发现公共财物已经被非法侵吞;而挪用罪的行为表现为擅自决定动用本单位，虽然有时也采取一些欺骗手段，但一般不采用侵吞、盗窃、骗取手段。
法律依据：《中华人民共和国刑法》
第三百八十二条 国家工作人员利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有公共财物的，是贪污罪。受国家机关、国有公司、企业、事业单位、人民团体委托管理、经营国有财产的人员，利用职务上的便利，侵吞、窃取、骗取或者以其他手段非法占有国有财物的，以贪污论。与前两款所列人员勾结，伙同贪污的，以共犯论处。
第三百八十四条 国家工作人员利用职务上的便利，挪用归个人使用，进行非法活动的，或者挪用数额较大、进行营利活动的，或者挪用数额较大、超过三个月未还的，是挪用罪，处五年以下有期徒刑或者拘役；情节严重的，处五年以上有期徒刑。挪用数额巨大不退还的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑。挪用用于救灾、抢险、防汛、优抚、扶贫、移民、救济款物归个人使用的，从重处罚。
