公司注销后，公司终止，法人资格消灭，所以借款协议无效，但在公司注销前，公司要清偿债务，借款协议未到期的，视为到期，公司要清偿完债务后才能注销。
《中华人民共和国公司法》第一百八十六条【清算程序】清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，应当制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民确认。
公司财产在分别支付清算费用、职工的工资、社会保险费用和法定补偿金，缴纳所欠税款，清偿公司债务后的剩余财产，有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。
清算期间，公司存续，但不得开展与清算无关的经营活动。公司财产在未依照前款规定清偿前，不得分配给股东。
第一百八十【公司注销】公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。
一、公司注销个人借款如何处理
如果欠款公司是注销的，可以向公司的股东追讨，股权股东信息也可以向工商部门查询。如果被追讨的股东出示了股权比例，也可以按出资比例追讨，没必要追着一个股东不放，必竟欠款是所有股东承担。
《中华人民共和国公司法》
第一百八十六条清算组在清理公司财产、编制资产负债表和财产清单后，应当制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民确认。
公司财产在分别支付清算费用、职工的工资、社会保险费用和法定补偿金，缴纳所欠税款，清偿公司债务后的剩余财产，有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。
清算期间，公司存续，但不得开展与清算无关的经营活动。公司财产在未依照前款规定清偿前，不得分配给股东。
第一百八十公司清算结束后，清算组应当制作清算报告，报股东会、股东大会或者人民确认，并报送公司登记机关，申请注销公司登记，公告公司终止。
二、有限责任公司债务由谁承担
一般情况下，有限责任公司的债务首先用公司的所有财产来清偿债务，除非股东没有完成出资或有损害债权人利益行为，要在出资范围内清偿债务，否则公司债务就跟股东没有关系。不过，一人有限责任公司的股东不能证明公司财产跟自己的财产分开时，就要对公司债务承担连带责任。
有限责任公司清偿债务的方式
（1）用公司的全部资产来还债，公司资产包括公司的有形资产和无形资产，有形资产包括办公设备，厂房，机器，土地等，无形资产包括专利，商标，债权债务等等。
（2）有限公司的股东滥用股东权力，损害债权人利益，要在出资范围内对公司债务承担责任。
一人有限公司的股东，提供以下证据可避免承担债务：
（1）提供财务、会计方面的资料作为证据，如公司的资产负债表、损益表、纳税申报表和地税纳税申报表。
（2）申请对一人公司的财产状况，委托有关司法会计审计机构进行财务审计，为证明一人公司的财产并未出现财产混同的情况提供有效的证据。
