1、填写退税申请表,附上税票、原、红字、重开的复印件,交办税服务厅办税窗口。审批、退库的事是税务人员干的程序。
2、出口企业和其他单位丢失专用的联和抵扣联的，经认证相符后，可凭专用记账联复印件及销售方所在地主管税务机关出具的丢失专用已报税证明单，向主管税务机关申报退(免)税。
出口企业和其他单位丢失专用抵扣联的，在专用认证相符后，可凭专用的联复印件向主管出口退税的税务机关申报退(免)税。
一、专票是否可以跨年抵扣
专用可以跨年认证入帐。
专用跨年扫描认证是可以的。认证期限是180日。不受是否跨年度。在规定时间内未进行认证，不能抵扣进项税额，但是还是可以入账处理的。
购进的物资未验收入库，但对方专用已经开具，购进方取得的时间推后，在取得专用后才入账，这种情况也会存在的，是合理的。
一般纳税人取得2010年1月1日以后开具的专用、公路内河货物运输业统一和机动车销售统一，应在开具之日起180日内到税务机关办理认证，并在认证通过的次月申报期内，向主管税务机关申报抵扣进项税额。
二、还要勾选认证吗？
专用认证是为了判断的真伪，就是税务机关通过防伪税控系统对专用所列的数据进行识别和确认。简单的说就是将抵扣联上的密文解密，和票面上的明文数据进行匹配，相符就是认证相符，有一项或者多项不符就是认证不符。
最开始时候认证实行的是上门认证，纳税人每个月都需要到办税大厅进行专用进行认证，去了之后，就是把专用给了税务人员等待认证就可以了，这种方式，纳税人跑得辛苦，税务机关的工作量也很大。
后来实行的是网上扫描认证，这种方式需要纳税人购买专用扫描仪，工作步骤就是打开扫描仪－－－－将当月需要认证的专用凭证反面放到扫描仪内－－－－－生成税局需要的格式－－－－－将所有扫描完整无误的文件打包上传－－－－－等待税局认证结果－－－－认证通过后－－－下载认证通知书保存到电脑就可以了。认证即表示参与抵扣，无需进行其他操作。但如果扫描不显示或者显示信息不完整税局系统不识别2次以上，你就得带上你的票和清单上门认证了。
随着金税三期的不断发展，电子底账不断完善，从2016年开始到2019年，税务总局逐步推行取消认证，所谓取消认证是指，纳税人取得专用，可以不再进行上门认证或扫描认证，而是通过各省的查询平台，查询、选择用于申报抵扣或者出口退税的信息。
这种方式操作很简单，就是登录上去，勾选要抵扣的，然后点击确认就可以了。这种便捷的申报抵扣方式应该叫勾选确认，它不属于认证，但因为很多人习惯性地称之为勾选认证，而2019年8号文件又说取消认证了，结果把很多人都搞晕了，以为也不需要勾选确认抵扣的了，其实不是这个意思，还是需要勾选确认的，当然，如果纳税人习惯扫描认证，也可以继续扫描认证。
