肇事逃逸后，即便是双方当事人在交警的协助下达成和解协议，交警部门也会根据事故损失大小对逃逸车主进行处罚。
法律依据：《道路交通事故处理程序规定》第二十条 发生可以自行协商处理的财产损失事故，当事人可以通过互联网在线自行协商处理；当事人对事实及成因有争议的，可以通过互联网共同申请机关交通管理部门在线确定当事人的责任。
当事人报警的，交通、警务辅助人员可以指导当事人自行协商处理。当事人要求交通到场处理的，应当指派交通到现场调查处理。
《道路交通事故处理程序规定》第二十二条 当事人自行协商达成协议的，可以按照下列方式履行道路交通事故损害赔偿：
（一）当事人自行赔偿；
（二）到投保的保险公司或者道路交通事故保险理赔服务场所办理损害赔偿事宜。
当事人自行协商达成协议后未履行的，可以申请人民调解委员会调解或者向人民提起民事诉讼。
第六十一条 当事人有下列情形之一的，承担全部责任：
（一）发生道路交通事故后逃逸的；
（二）故意破坏、伪造现场、毁灭证据的。
为逃避法律责任追究，当事人弃车逃逸以及潜逃藏匿的，如有证据证明其他当事人也有过错，可以适当减轻责任，但同时有证据证明逃逸当事人有第一款第二项情形的，不予减轻。
